L'École Chrétienne Emmanuel a ouvert un nouveau secteur secondaire français en Septembre 2009 qui offre maintenant les classes de 1ère à 4e secondaire. La 5e secondaire sera offerte en Septembre 2012. Ce secteur secondaire français offre un programme académique stimulant de haut calibre qui prépare les élèves aux examens de fin d'études secondaires en vue d'obtenir le Diplôme d'études secondaires(DES), formation générale du Ministère de l'Éducation, du Loisir et du Sport du Québec (MELS).

Ceci s'accomplit dans le contexte d'une perspective chrétienne qui comprend les éléments suivants:

• Les dévotions matinales quotidiennes d'une quinzaine de minutes dans chaque classe qui incluent la lecture de la Bible et la prière.
• Des assemblées dirigées par les élèves qui comprennent une lecture biblique, des chants, la prière et parfois des invités chrétiens.
• Des assemblées pour célébrer des événements spéciaux du calendrier chrétien.
• Un cours d'enseignement biblique à raison de trois périodes par cycle.
• Des enseignants qui appuient entièrement la profession de foi de l'école et présentent une perspective chrétienne du monde et de la vie dans tous leurs cours.

Le programme de l'école offre:

• Un système de sanction des études tel que défini par le Régime Pédagogique du Ministère de l'Éducation, du Loisir et du Sport du Québec.
• Un programme de science et de mathématiques conçu pour préparer l'élève qui le veut et qui en est capable pour entrer en Sciences de la santé ou Sciences pures au CEGEP.
• L'accès à un laboratoire d'ordinateurs et à une salle de projets pour les devoirs et le travail de cours.
• Des périodes de récupération à l'heure du dîner.
• Une mission locale et internationale en 3e secondaire.
• Un concours annuel d'Art oratoire dans le cadre du cours de français. Les gagnants se rendent aux compétitions avec d'autres écoles.
• Un programme Domaine d'Art offert à tous les niveaux.