Emmanuel ouvrit ses portes en 1975 à 38 élèves de secondaire 1 et 2 dans les locaux de l'ancienne école primaire Surrey Gardens qui faisait partie de la commission scolaire protestante de Montréal. Une classe additionnelle s'ajouta pendant des trois années suivantes et les premiers finissants reçurent leurs diplômes en 1979.

Dès que le secondaire fut solidement établi, les parents commencèrent à réclamer l'ouverture d'une école primaire. Donc, la maternelle, première et deuxième année ouvrirent en septembre 1981, suivies par la troisième et la quatrième année en 1982 et la cinquième et la sixième en 1983. Dès lors, l'École Chrétienne Emmanuel offrit une éducation complète de la maternelle jusqu'en secondaire 5.

En 1991, après 16 ans de location à Dorval, l'école se mit à la recherche d'un site permanent. L'école loua pour deux ans des locaux temporaires sur le boulevard Gouin à Pierrefonds, pour s'établir en permanence dans un bâtiment rénové sur le boulevard St-Jean à Dollard-des-Ormeaux.

En l'an 2005 nous avons célébré notre 30ième anniversaire et en 2009 nous avons eu la joie d'ouvrir un nouveau secteur secondaire français qui grandit d'année en année. Ce secteur offrira tous les niveaux de la 1ère à la 5e secondaire en septembre 2012.